ジパングの中央に位置する神秘に彩られた花の島「アワジアイランド」。狩猟を司る「男神イザナギ」、豊穣を司る「女神イザナミ」この２人の神がアワジアイランドをつくり、民と共にゆるやかで平穏な日々を送っていた。
時は流れ、オニオン歴９０年。男神イザナギ、女神イザナミ、そしてイザナミの親友「妖精セパ」は、いつもと変わらぬ平穏な日々を送っていた。しかし突如「魔人ダイジシン」率いる魔人軍が地底深くの冥界から、アワジアイランドに侵攻を開始。魔人ダイジシンの目的は「地上界の支配」。アワジアイランドの民と、愛する女神イザナミを守るため、男神イザナギが魔人軍の前に立ちはだかる。
アワジアイランド全体に結界を張り巡らせ、魔人軍の侵攻を食い止めて来た男神イザナギであったが、オニオン歴９５年、魔人ダイジシンの放った痛恨の一撃が結界を破りアワジアイランドの北部に命中。その一撃は大地に大きな傷跡を残すほどの威力で、アワジアイランドはそれを機に大きな混乱に陥ってしまった。その混乱の最中、魔人軍大参謀「魔人カサイ」が女神イザナミを連れ去ってしまう。男神イザナギは女神イザナミを守りきれなかった事を悔いながら、それでも残った民の為に必死の抵抗を試みるが、日に日に戦況は悪化していった。戦う術を持たない民達は祈ることしかできない。アワジアイランドを訪れる旅人達の中に、男神イザナギと共にこの島を救ってくれる勇者がいることを...。